细胞基因敲除技术（KO技术），如同精准的分子手术刀，已成为解析基因功能、验证药物靶点、构建疾病模型的黄金标准。其核心逻辑在于：移除特定基因 → 观察表型变化 → 反推基因功能

核心实验流程与原理

01、靶点设计与gRNA合成

原理：基于CRISPR/Cas9系统，设计靶向目标基因关键外显子的向导RNA（gRNA）。gRNA如同"导航仪"，引导Cas9核酸酶精准定位基因组特定位点。

关键点：gRNA设计需兼顾特异性（避免脱靶效应）和切割效率。常用生物信息学工具预测评分。

02、基因编辑工具递送

原理：将含有Cas9和gRNA的载体（质粒、慢病毒、腺相关病毒）或核糖核蛋白复合体（RNP）导入目标细胞。

常用方法

电穿孔 (Electroporation)：利用瞬时高电压在细胞膜上形成可逆小孔，适用于多种细胞（尤其原代/难转染细胞）。效率与细胞存活率是关键挑战。

脂质体转染 (Lipofection)：利用阳离子脂质体包裹核酸形成复合物，与细胞膜融合递送。操作简便，适用于易转染细胞系。

病毒转导 (Viral Transduction)：利用慢病毒/腺相关病毒载体感染细胞，实现稳定整合或瞬时表达。适用于难转染细胞和体内实验。

03、DNA双链断裂 (DSB) 与修复

原理：Cas9在gRNA引导下切割目标DNA，产生双链断裂（DSB）。

细胞启动自身修复机制

非同源末端连接 (NHEJ)：主要修复途径。易引入插入或缺失突变（Indels），导致基因移码或提前终止，实现基因敲除 (KO)。

同源定向修复 (HDR)：效率较低。需提供外源DNA模板，可实现精准敲入或点突变。

04、细胞筛选与单克隆化

原理：利用药物筛选标记（如Puromycin, Blasticidin）或流式分选（如荧光报告基因），富集成功转染/感染的细胞。随后进行有限稀释法 (Limiting Dilution)或流式细胞分选 (FACS)，分离单个细胞培养成单克隆细胞株。

05、基因型验证

原理：确认目标基因是否被成功敲除及敲除效率

关键方法

PCR + 测序 (Sanger/NGS)：扩增靶点区域，检测Indels。金标准，可确认具体突变类型

T7 Endonuclease I (T7E1) / Surveyor 酶切检测：检测PCR产物中因Indels形成的异源双链，评估编辑效率

Western Blot / 流式检测 (FACS)：直接检测目标蛋白表达是否缺失，确认功能敲除

06、表型分析与功能验证

原理：在KO细胞模型上进行实验，观察与野生型细胞在增殖、凋亡、迁移、代谢、信号通路激活、药物敏感性等方面的差异，阐明目标基因功能或验证靶点有效性。

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